DEA untuk Praktisi Bioinformatika

Mengotomatiskan analisis ekspresi diferensial

Fungsinya

Aplikasi ini berguna untuk menemukan gen yang paling representatif berdasarkan sampel. Analisis ekspresi diferensial adalah metode untuk menguraikan interaksi antara gen dan lingkungannya.

Aplikasi dibuat berdasarkan arsitektur berbasis layanan. “Front” menggunakan Flutter SDK, yang dienkode dalam “Dart”, antarmuka grafis meminta file CSV tempat sampel berada dan Anda ingin menemukan gen yang paling representatif di “set data” tersebut.

“Backend” dienkode dalam Python menggunakan library “FastAPI” dan server web “Uvicorn”. Keajaiban Gemini ada di bagian belakang, menggunakan framework “Langchain”. Pada fase pertama, gen yang paling mewakili berbagai “bagian” akan ditemukan. Setelah daftar gen yang paling mewakili dari berbagai “bagian” tersedia, Gemini akan diminta untuk menemukan gen yang paling mewakili, yang memberikan deskripsi tentang proses yang dilakukan dan penjelasan tentang gen yang ditemukan.

Dibuat dengan

  • Flutter
  • Web/Chrome

Tim

Oleh

Herbert Corredor

From

Kolombia