DEA для биоинформатиков

Что он делает

Приложение полезно для поиска наиболее репрезентативного гена в образце. Анализ дифференциальной экспрессии — это метод расшифровки взаимодействия между генами и их окружением.

Приложение создано на основе архитектуры на основе сервисов. «Фронт» использует Flutter SDK, закодированный в «Dart», графический интерфейс запрашивает CSV-файл, где находятся образцы, и вы хотите найти наиболее репрезентативный ген в этом «наборе данных».

«Backend» написан на Python с использованием библиотек «FastAPI» и веб-сервера «Uvicorn». Магия Gemini находится сзади, с использованием фреймворка «Langchain». На первом этапе находятся наиболее репрезентативные гены различных «кусков». Как только список наиболее репрезентативных генов различных «кусков» становится доступным, Gemini просят найти наиболее репрезентативный ген, давая описание выполненного процесса и объяснение найденного гена.