Biyoinformatikçilere yönelik DEA

Ne işe yarar?

Uygulama, bir örnekte en temsili geni bulmak için yararlıdır. Farklı ifade analizi, genler ile çevreleri arasındaki etkileşimi çözmek için kullanılan bir yöntemdir.

Uygulama, hizmet tabanlı bir mimaride oluşturulur. "Ön uç", "Dart" ile kodlanmış Flutter SDK'sını kullanır. Grafik arayüz, örneklerin bulunduğu CSV dosyasını ister ve bu "veri kümesinde" en temsili geni bulmak istersiniz.

"Arka uç", "FastAPI" kitaplıkları ve "Uvicorn" web sunucusu kullanılarak Python'da kodlanmıştır. Gemini'nin asıl büyüsü, arka planda "Langchain" çerçevesini kullanmasıdır. İlk aşamada, farklı "parçaların" en temsili genleri bulunur. Farklı "bölümlerin" en temsili genlerinin listesi oluşturulduktan sonra Gemini'den en temsili geni bulması istenir. Bu işlem sırasında yürütülen sürecin ve bulunan genin açıklaması da verilir.